制冷系统是
冻干机的重要组成部分，其主要作用是给冷阱和隔板（板层）降温和控温。而最常见的制冷系统是由压缩机及制冷剂为主体的机械制冷系统。但随着制药行业不仅要面对生产工艺性能和可靠性的压力，同时还要遵守越来越严格的环境标准。致使
冻干机用户不得不去考虑应用更加能符合环保要求的低温冷却技术。
液氮是一种高效、方便的制冷剂。由于其极低的沸点（约–196℃），它也是大多数低温应用案例所使用的制冷剂。因此，当提到液氮制冷时，人们的第一反应就是其具有更好的制冷效率。毋庸置疑，当冻干机根据工艺要求追求较低温度和快速降温速率时，传统冻干机上应用的机械制冷系统存在性能上的制约。当配合低温流动性好的导热流体时，液氮制冷可以做到板层温度-30°C以下仍能实现近乎线性降温，极限温度低于-65摄氏度。
除去性能方面的差异，液氮制冷系统还会有以下*的优势：
1、环保和安静运行，随着全球对环境保护标准的提高，无论从企业社会责任角度而言，还是一些发达国家的法规约束来看，制冷剂的选择都应考虑不对臭氧层进行破坏，因此CFC和HCFC制冷剂逐步被取代或应用成本上涨已经成为必然的趋势。
2、低维护.无论是活塞式压缩机还是螺杆式压缩机，其内部都具有运动机械部件，同时制冷剂的压缩冷凝、中间冷却、膨胀挥发等过程还需要一系列机械部件构成整个制冷系统。因此相比而言，以换热器为主体的液氮制冷系统的维修维护概率自然会显得更低。
3、回收的可能性.液氮在进行制冷换热后，也是最终会成为气态形式排放，而氮气是制药企业通常会考虑的气体之一。因此液氮制冷系统带来了成为氮气供应源的可能性，当然，能否变为实际应用还是要依靠气体供应商的系统解决方案。
